磁力泵運轉時，須用少量的液體對內磁轉子與隔離套之間的環(huán)隙區(qū)域和滑動軸承的摩擦副進行沖洗冷卻。

冷卻液的流量通常為泵設計流量的2%-3%，內磁轉子與隔離套之間的環(huán)隙區(qū)域由于渦流而產生高熱量。當冷卻潤滑液不夠或沖洗孔不暢、堵塞時，將導致介質溫度高于永磁體的工作溫度，使內磁轉子逐步失去磁性，使磁力傳動器失效。

當介質為水或水基液時，可使環(huán)隙區(qū)域的溫升維持在3-5℃；當介質為烴或油時，可使環(huán)隙區(qū)域的溫升維持在5-8℃。